Bioinformatik - Blast

Övningen är skapad 2022-05-31 av PopcornDidde. Antal frågor: 9.

Klicka

Lär dig orden

Skriv

Stava orden

Lyssna

Lyssna

Spel

Spela spel

Skriv ut

Öva på papper



Välj frågor (9)

Vanligtvis används alla ord som finns i en övning när du förhör dig eller spelar spel. Här kan du välja om du enbart vill öva på ett urval av orden. Denna inställning påverkar både förhöret, spelen, och utskrifterna.

Alla Inga

  • MEGABLAST Designed for long alignments between similar sequences. Provides adjustable percent identity.
  • Blastn Finds related or similar matches to nucleotide sequence
  • Blastp Identifying query aa sequence and finding similar sequences in protein databases.
  • Psi-blast Used for finding very distantly related proteins, or new members of a protein family.
  • Phi-blast Searches with a query sequence and a user-specified pattern.
  • Blastx translates nucleotide query into all six reading frames, and uses it to search a protein database.
  • tblastn compares protein query to the six frame translations of a nucleotide database
  • tblastx translates nucleotide query into all six reading frames and compares them to a nucleotide database were all sequences are translated into all six reading frames. (nuclear option)
  • Does Blast have an MSA function? No, all the blast tools are PSA based.

Alla Inga

(
Utdelad övning

https://spellic.com/swe/ovning/bioinformatik-blast.10974675.html

)