biokemi, proteiner

globulära proteiners typiska egenskaper kompakta, hydrofila

fibrösa proteiners typiska egenskaper linjära, hydrofoba

fibrösa proteiners huvudfunktioner struktur

proteinfunktioner enzymer, struktur, motor, transport, signal, regulation

alla tjugo aminosyror är alfa-L

andra kolet, första kolet efter karboxylgruppen heter: alfakolet

alfakolet binder R-grupp, egen aminosyras kväveatom

karboxylkolet binder dubbelbundet syre, annan aminosyras kväve

egenskapen då aminosyrorna har ett kol med 4 potentiella olika bindningar, vilket ger spegelvända isomerer kiralitet

spegelbilder av samma aminosyra enantiomer, stereoisomer

amingruppens pKa pK2

karboxylgruppens pKa pK1

amnigruppen är bas eller syra bas

karboxylgruppen är en bas eller syra syra

aminosyrans form vid lågt pH fullt protonerad

aminosyran då en grupp är positiv och en negativ, aminosyran är oladdad zwitterjon

aminosyran i högt pH fullt deprotonerad

polära aminosyror serin, treonin, tyrosin, asparagin, glutamin

positiva aminosyror histidin, arginin, lysin

negativa aminosyror asparaginsyra, glutaminsyra

BCAA leucin, valin, ieoleucin

aromatiska aminoryror fenylalanin, tryptofan, tyrosin

kan bilda disulfidbryggor cystein

räknas asparaginsyra och glutaminsyra(negativa sidogrupper) som baser eller syror? syror(de avger sin proton)

är histidin, arginin och lysin syror eller baser?(positiva) baser(de tar upp en proton)

den joniseringsbara 5-kolsringen med ett kväve i sig hos histidin: imidazolgrupp

är histidin reaktivt i protonerad eller deprotonerad form deprotonerad form

essentiella aminosyror valin, leucin, ieoleucin, metionin, fenylalanin, tryptofan, treonin, histidin, lysin

bildning av peptidbindning då vatten avgår kondensation

då kolen med R-grupper, på varsin sida om peptidbildningen vänds åt samma håll, vilket ger närhet mellan R-grupperna cis-konfiguration

peptidbindningen har karaktär av: dubbelbindning

psi uttalande psai

phi uttalande faj

rotation mellan alfa-karbonyl psi

rotation mellan alfa och kväve phi

vad ger sekundärstruktur periodiskt upprepade psi och phi

Inte lika ordnade varianter av proteiner på engelska intrinsically disordered proteins

Click