BITO prov v.13, NA22 år2 CRISPR-Cas9, PCR, TRANSF.

The exercise was created 2024-03-21 by 060204al. Question count: 52.




Select questions (52)

Normally, all words in an exercise is used when performing the test and playing the games. You can choose to include only a subset of the words. This setting affects both the regular test, the games, and the printable tests.

All None

  • Vilka två metoder finns för att masskopiera DNA? kloning, PCR
  • Hur går kloning av gener till? den intressanta genen klipps ut och förs in i en vektor, när vektorn replikeras gör även genen det
  • Vad är en vektor? bakterieplasmid eller virus
  • Vad skiljer PCR från kloning? möjligt att analysera mycket små mängder av DNA från ett fåtal celler
  • Vad står PCR för? polymerase chain reaction
  • Inom vilka olika områden (ex.) är PCR användbart? molekylärbiologisk och genetisk forskning, medicin, brottsutredningar
  • Vad kan man exempelvis andvända PCR till inom medicin? identifiera viss bakterie eller virus, ta reda på om ett embryo bär visst anlag
  • Hur mycket DNA krävs för att man ska kunna genomföra en PCR? ett fåtal celler med DNA
  • PCR liknar den naturliga replikationsmetoden. Skillnader? istället för att enzymer delar DNA-strängarna används värme för att bryta bindningarna, annat DNA-polymeras, specifika primrar för ändamålet
  • Varför används primrar vid PCR? DNA-polymeras behöver något att fästa den första nukleotiden vid
  • Hur stora är primrarna som används vid PCR? Varför? minst 20 kvävebaser, kan fästa på annan sekvens på fel ställe annars
  • Hur många primrar behöver man vid PCR? flera av två olika, en typ som är komplementär till ena DNA-strängen och en typ komplementär till den andra
  • När man ska göra PCR blandas en reaktionsblandning. Vad ingår i den? DNA, primrar, buffertlösning, DNA-polymeras, nukleotider, magnesiumjoner
  • Varför används magnesiumjoner vid PCR? krävs för att aktivera DNA-polymeras
  • Vilken typ av DNA-polymeras används vid PCR? Varför? Varifrån har man tagit den? Taq-polymeras, värmetåligt, bakterien Thermus aquaticus
  • Vad fick man göra vid PCR, innan man började använda Taq-polymeras? Varför? tillsätta nytt DNA-polymeras för varje ny cykel, förstördes av värmen
  • Hur fungerar/görs PCR? reaktionsblandning placeras i PCR-maskin, 95 grader -> DNA-strängar separeras, 53-60 grader -> primrarna binder till varsin DNA-sträng, 72 grader -> Taq-polymeras bygger komplementär DNA-kedja, repetera
  • Det finns en formel som anger hur många DNA-kopior som finns efter n cykler. Ange den. 2^n
  • Hur många kopior av DNA-sekvensen finns efter 30 PCR-cykler? över en miljard
  • Om man gör PCR av den enklare typen, i liten skala, hur förbereder man? reaktionsblandningen tillsätts i portioner om 10-50 mikroliter till små plaströr som placeras i PCR-maskinen
  • Vad står GFP för? green fluorescent protein
  • Vilket protein är ett av de mest använda inom cellbiologisk forskning? Varför? GFP, studera/se processer som sker inuti celler
  • Hur kan GFP vara fluorescerande? absorberar blått ljus och UV-ljus, emitterar grönt ljus
  • Vad krävs för att CRISPR-Cas9 ska klippa på rätt plats? Vad händer om den inte vet? enkelsträngat guide-RNA (sgRNA), den klipper inte
  • Vilka fördelar finns med PCR? enkelt, specifikt, relativt billigt, kräver bara lite DNA
  • Varför blir resultatet av den första PCR-cykeln en längre DNA-sträng än målsekvensen? finns inget stopp
  • Efter hur många PCR-cykler har de flesta DNA-fragmenten som kopieras önskad längd? 30
  • Vad är templat? DNA som ska kopieras
  • Vad är buffert? rätt pH och jonstyrka
  • Vad är GFP-protein? protein från maneten A.victoria som fluorescerar vid belysning med UV-ljus
  • Vad är en rapportörgen? en gen som sätts in för att följa en process, lätt att detektera
  • Det finns tre sätt att introducera främmande DNA i en bakterie. Vilka? transformation, konjugation, transduktion
  • Varifrån kommer det främmande DNA:et vid transformation? omgivningen
  • Varifrån kommer det främmande DNA:et vid konjugation? bakterie
  • Varifrån kommer det främmande DNA:et vid transduktion? bakteriofag
  • Hur kan man artificiellt framkalla transformation? kyla och värmechock, elektrporering (elstötar)
  • Vad innehåller de designade plasmiderna inom gentekniken? origin, promotor, plats där gen kan klippas in, inklippt gen, antibiotikaresistens, bindningsplats för primer (för PCR), ev. rapportörgen
  • Varför centrifugerar man prover med arvsmassa? fragment sorteras efter storlek, störst längst ut/ner
  • Vad är lysozym? ett enzym som förstör bakteriers cellväggar genom att klyva polysackarider
  • Var kan vi naturligt hilla lysozym? i tårvätska och bröstmjölk
  • Hur lyserar/renar man prover? centrifugering, enzymet lysozym, frysning förstör cellmembran och fullbordar sönderdelning av cellvägg
  • Vad är kromatografi? separationsmetoder inom analytisk kemi
  • Vad är HIC-kromatografi? Vad används det till? kromatografi genom hydrofobisk interaktion, separera proteiner i en blandning
  • Hur funkar HIC-kromatografi? proteiner har aminosyror med olika egenskaper och vissa är hydrofobiska, ju mer hydrofobiska desto mer interaktion med kolonnmaterialet, ändra salthalt i bufferten för att tvinga proteinerna att ändra form och därmed ändra förmågan att interagera med kolonnmaterialet
  • HIC-komatografi har tre stadier. Vilka? bindning, tvätt, eluering
  • Vad händer under HIC-kromatografins bindnings-fas? proteiner ändrar form så att hydrofobiska delar exponeras mot kolonnen
  • Vad händer under HIC-kromatografins tvätt-fas? proteiner som binder svagt till kolonnen tappar taget när de delvis ändras tillbaka till sin ursprungsform
  • Vad händer under HIC-kromatografins eluerings-fas? de mer hydrofila sidorna på proteinet vänds utåt och även de proteiner som bundit hårdare släpper taget om kolonnen
  • Hur hög är salthalten under HIC-kromatografins bindnings-fas? 4 mol/dm^3
  • Hur hög är salthalten under HIC-kromatografins tvätt-fas? 1,3 mol/dm^3
  • Hur hög är salthalten under HIC-kromatografins eluerings-fas? 10 mmol/dm^3
  • Vilket salt används vid HIC-kromatografi? (NH4)2 SO4

All None

(
Shared exercise

https://spellic.com/eng/exercise/bito-prov-v-13-na22-ar2-crispr-cas9-pcr-transf.11999478.html

)