BITO prov v.13, NA22 år2 DNA

Vilka stora biologiska molekyler samspelar i allt känt liv, på jorden? DNA, RNA, proteiner

Vad gör proteiner? utför det mesta av aktiviteten i levande varelser

Vad gör DNA och RNA? främst bär och förmedlar information, bl.a. om proteinernas uppbyggnad

Arvsanlag förs vidare från generation till generation, hos levande varelser. Var finns arvsanlaget? i DNA-molekylerna i kromosomerna

Hur är DNA-molekylen uppbyggd? två långa, antiparallella kedjor av deoxiribonukleotider, vars kvävebaser pekar in mot varandra

Hur är deoxiribonukleotider uppbyggda? en ringformad sockermolekyl uppbyggd av 5 kolatomer, som 3 fosfatgrupper och 1 kvävebas fäster till

Vilka nukleotider kan finnas i deoxiribonukleotiden? cytosin, guanin, adenin, tymin

Hur sätts deoxiribonukleotiderna ihop till en DNA-kedja? två yttersta fosfatgrupperna spjälkas bort, den innersta fosfatgruppen fäster till en fri OH^- på sockermolekylen

Hur 'ser' en DNA-kedja ut / 'uppbyggd'? omväxlande socker- och fosfatgrupper med kvävebaser utstickande, ena änden har 3 fosfatgrupper fästa vid sockrets 5 kolatom (5'-ände), andra änden har en fri OH^--grupp som sitter på sockrets 3:e kolatom (3'-ände)

Vilken riktning har DNA? 5' till 3'

I vilken ände på en DNA-kedja kan nya deoxiribonukleotider fästas? 3'-änden

Vad kallas ett socker uppbyggt av 5 kolatomer? deoxiribos

Hur hålls de två DNA-kedjorna i DNA-molekylen ihop? vätebindningar mellan kvävebaserna, A binder till T och C binder till G,

Vad kallas bindingen mellan kvävebaserna i DNA-molekylen? Vad sägs om DNA-kedjorna? basparning, två kedjor som kan baspara med varandra är komplementära

Hur kan man utnyttja att två DNA-kedjor är komplementära? kopiera DNA-molekyler

Vad kallas de lite större kvävebaserna? puriner

Vad kallas de lite mindre kvävebaserna? pyrimidiner

Vilka kvävebaser är puriner? A, G

Vilka kvävebaser är pyrimidiner? T, C, U

Vad består adenin av? en dubbel ringstruktur av kol- och kväveatomer

Vad består guanin av? en dubbel ringstruktur av kol- och kväveatomer

Vad består cytosin av? en enkel ringstruktur av kol- och kväveatomer

Vad består tymin av? en enkel ringstruktur av kol- och kväveatomer

Hur binds cytosin och guanin ihop? 3 vätebindningar

Hur binds adenin och tymin ihop? 2 vätebindningar

Vad innebär Chargaffs regel? mängden A = mängden T, mängden G = mängden C

Vilka baspar krävs mest energi för att bryta? G-C-baspar

Hur ser själva DNA-molekylen ut / är uppbyggd? två DNA-kedjor lindas rund varandra och bildar en dubbelhelix, helixen innehåller två olika stora klyftor

Vad kallas DNA-molekylens klyftor? Vad är botten i dem? minor groove och major groove, basparens kant (där de binds ihop)

Var kommer proteiner åt kvävebaserna i DNA-molekylen för att läsa av generna? Hur? Vilka proteiner? i major groove, så stor att proteinet kommer åt att känna av kvävebasordningen, de protein som behöver en speciell sekvens har en utskjutande del som glider fram i major groove och bildar vätebindningar mot igenkänningssekvensen, proteiner som startar och reglerar kopiering och avläsning av DNA och klipper DNA

Ex. på viktiga experiment som ledde fram till upptäckten av att arvmassan består av DNA: Griffiths transformationsprincip, Averys demonstration av att arvsmassan består av DNA, Herseys och Chases experiment med fager

Vad bestämmer vilken information DNA-molekylen bär? kvävebasordningen

Vad är ett viktigt stöd för teorin om att allt liv har gemensamt ursprung? alla levande organismer har arvsanlag med samma kvävebaser

Vad kallas en organisms alla DNA-molekyler? ett genom

Annat ord för DNA-molekyl: kromosom

Hur varierar genomet mellan olika arter? storlek, antal gener

Vad innehåller genomet i en människocell? 46 kromosomer med 3000 miljoner baspar med ca 19000 gener

Vad innehåller genomet i en cell av E.coli? 1 kromosom med 4,4 miljoner baspar med drygt 4000 gener

Vilken art i världen har störst genom? Latinskt namn? Rike? Antal baspar? japanskt ormbär, Paris japonica, växt, 149 000 miljoner baspar

Hur betecknar man 'miljoner baspar'? Mb

Hur definierar den klassiska genetiken begreppet 'gen'? det som ger en organism en viss fenotyp

Vad är en mer heltäckande definition av begreppet 'gen'? Vilka fler definitioner finns att tillägga? en gen är en sekvens av DNA som kodar för en polypeptid eller en RNA-molekyl, eukaryota cellers gener innehåller icke-kodande sekvenser, de promotorregioner och reglerande regioner kopplade till en viss gen räknas ibland som en del av genen

Varför är det inte lätt att ge en definition av begreppet 'gen'? definition har ändrats med tiden, olika definitioner beroende på sammanhang

Vad är den grundläggande 'uppgiften' för de flesta gener? Hur? koda för proteiner, ange ordningsföljden av aminosyror i ett visst proteins aminosyrakedja

Hur många 'DNA-ord' behövs totalt för att beskriva proteiner? Varför? 22, 20 grundläggande aminosyror + start + stopp

Hur många 'bokstäver' (kvävebaser) bygger upp 1 'DNA-ord'? Hur många 'ord' kan då bildas totalt? 3, 64 (4^3)

Varför finns det 'synonymer' i 'DNA-språket'? behövs 22 ord, finns 64

Hur många 'synonymer' finns det för 'start' i en gen? 1

Hur många 'synonymer' finns det för 'stopp' i en gen? 3

Vad består en s.k. öppen läsram av? en DNA-sekvens med 1 startkod, tillräckligt många tripletter för att koda för ett protein, en stoppkod

Generellt namn + förkortning för 'öppen läsram': open reading frame, ORF

Stora delar av arvsmassan beskriver inte proteiner. Vad beskriver det istället? RNA-molekyler

Hur beskriver DNA RNA? Skillnad? en kvävebas på DNA motsvarar samma kvävebas på RNA, U istället för T

Vad heter kvävebasen U? uracil

Invid generna i DNA-molekylen finns stora reglerande områden. Vad reglerar dem? Hur? när och hur mycket de intilliggande generna ska användas, innehåller sekvenser som känns igen av vissa proteiner som tar emot och reagerar på olika signaler till cellen och då underlättar eller försvårar avläsningen

Vad vet forskarna om de stora reglerande områdena i DNA, vid generna? tillräckligt för att förstå vissa korta sekvenser, inte tillräckligt för att tolka informationen

Hur förökar sig celler? genom delning

Vad kallas processen där DNA kopieras? replikation

Hur påbörjas replikationen av DNA? proteinet helikas öppnar dubbelhelixen genom att bryta basparningen, proteiner kallade topoisomeraser klipper av DNA-kedjor och lägger dem omlott och klistrar ihop så att dubbelhelixen lindas upp utan att hela molekylen ska behöva rotera inne i cellen

Hur byggs den nya DNA-kedjan vid replikationen? enzymet primas använder gamla DNA-kedjan som mall för en kort RNA-sträng (RNA-primer), DNA-polymeras III klipper bort två fosfater på 5'-änden av en ny byggsten och fäster den vid 3'-änden på den nya kedjan, DNA-polymeras I byter ut RNA-primern mot DNA så att det bildas en fullständig DNA-kedja

Vad krävs för att DNA-polymeras III ska kunna utföra sitt arbete? den nya DNA-kedjan ligger mot en gammal som fungerar som mall för att kvävebaserna ska vara komplementära, en RNA-primer eftersom enzymet endast kan bygga vidare

Varför säger man att replikationen har riktningen 5' till 3'? den nya byggstenen fästs vid 3'

Vad kallas den plats där DNA-replikationen startar? replikationsorigin

Vilka skillnader finns mellan DNA-replikation hos eukaryoter och bakterier? eukaryoter flera replikationsorigins men bakterier bara 1, fler typer av DNA-polymeras aktiva hos eukaryoter

Vid varje replikationsorigin bildas en liten 'bubbla' då DNA-kedjorna delas. Vad heter det som delar dem? Vart är det? replikationsgaffel, en i vardera riktining

De olika strängarna vid replikationsgafflarna har olika namn. Vad heter dem? leading strand, lagging strand

Vad är skillnaden mellan leading strand och lagging strand? vid leading strand byggs den nya DNA-kedjan kontinuerligt i samma riktning som replikationsgaffeln, vid lagging strand sker replikationen i steg i motsatt rikting mot replikationsgaffelns öppnande

Hur sker DNA-replikationen vid leading strand? en byggsten komplementär till kvävebas på orginal-kedjan bildar kvävebindningar mellan kvävebaserna och hålls på plats, DNA-plymeras katalyserar en reaktion där yttersta två fosfatgrupperna på byggstenen närmast kedjan som ska förlängas klipps bort, kvarvarande fosfatgruppen binder till OH^- vid 3'-änden på kedjan, enzymet flyttas vidare längs med replikationsgaffelns öppnande

Hur sker DNA-replikationen vid lagging strand? nya primers bildas då replikationsgaffeln fortsätter öppna helixen, samma process som leading strand en liten bit i 3'-5'-riktning, DNA-polymeras flyttas bakåt till nästa primer, repeterar, DNA-polymeras I byter ut RNA-primers mot DNA, enzymet ligas klistrar ihop alla småbitarna av DNA

Vad kallas de korta DNA-fragment, med varsin egen primer, som bildas vid DNA-replikation längs med lagging strand? Okazakifragment

Vad är skillnaden mellan en nukleosid och en nukleotid? nukleosid består av en kvävebas och en sockergrupp, nukleotid består av en kvävebas, en sockergrupp och en fosfatgrupp

Vad är en plasmid? liten ringformad extrakromosomal DNA-molekyl som förekommer naturligt hos många bakterier, eller framställs på konstgjord väg

Hur många igenkänningsställen har plasmider för replikation? 1

Varför liknas vissa plasmider vid små virus som förlorat sitt proteinhölje? Vad funderar forskarna över? vissa plasmider har förmågan att integreras i värdcellens arvsmassa, om dagens virus utvecklats från plasmider eller tvärtom

Vad händer när en bakterie dör? Vad kan hända med andra bakterier då? plasmider och bitar av bakteriens kromosom läcker ut i omgivningen, andra bakterier kan ta upp dem

Vad kallas det när en bakterie tar upp arvsmassa från omgivningen? transformation

Är transformation vanligt eller ovanligt på individnivå? ovanligt

När är det troligt att vissa bakterier tar upp DNA från omgivningen? om en bakteriepopulation med miljarder bakterier hamnar i en 'soppa' med DNA

Vad innebär det att bakterier är 'kompetenta'? de är bra på att ta upp DNA från omgivningen

Hur kan bakterier av släktet Haemophilus bli kompetenta? om de utsätts för syre- eller näringsbrist

Hur kan E.coli-bakterier bli kompetenta? om man tillsätter kalcium- eller magnesiumklorid och utsätter de omväxlande för värme och kyla

Vad är viktigt för att gener ska kunna överföras mellan bakterieceller och spelar en central roll i genetiken? transformation

Vad kan hända om det DNA en bakterie tagit upp liknar dess egen arvsmassa? Hur? det kan fogas in i dess egen arvsmassa, genom homolog rekombination

Vad händer om det DNA en bakterie tagit upp är en plasmid? plasmiden kan leva kvar och dela sig inuti bakterien

Vad står VNTR för? variable number of tandem repeats

Vad står STR för? short tandem repeats

Vad är transposoner? 'mobila' genetiska element, vissa delar av DNA som kan hoppa från en plats till en annan och andra som kan se till att det bildas en kopia av sig själv på ett annat ställe

Vad är VNTR? repetitivt DNA som inte består av transposoner

Hur uppkommer VNTR? av misstag under replikationen eller genom rekombination

Vad är STR? VNTR som består av 2-5 kvävebaser som upprepas gång på gång

Vad ingår mer i VNTR, än STR? långa sträckor av DNA som duplicerats genom att de kopierats från DNA-segment på en annan plats på kromosomen eller från en helt annan kromosom

Vilken typ av DNA utnyttjas vid genetiska fingeravtryck? VNTR

Vad är rekombinant DNA? DNA som bildas genom att kombinera DNA från olika källor genom en process som kallas genetisk rekombination

Vilka fördelar finns med att använda plasmider som vektorer? de är små, innebär att de är lätta att isolera och manipulera och kan replikeras oberoende av bakteriekromosomens replikation, innehåller ofta också en gen som gör det lätt att identifiera om plasmiden finns i en klon av bakterien

Vad är en vektor inom genteknik och molekylärbiologi? ett redskap för att föra in DNA i levande celler

Vad krävs att en plasmid har för att den ska kunna användas inom gentekniken? ett replikationsorigin, en bindningsplats för DNA-polymeras, polylinkers, gen för att identifiera de celler som tagit upp plasmiden

Vilken typ av gen används ofta i en plasmid, för att kunna identifiera celler som tagit upp den? Hur identifieras de sen? någon gen som kodar för antibiotikaresistens, bakterier som inte tagit upp plasmiden dör då de utsätts för antibiotikan

Vad är s.k. polylinkers? igenkänningsplatser för de restriktionsenzymer som används för att klippa upp plasmiden för att föra in egen gen

Vad kallas en plasmid man fört in främmande gener i? rekombinant plasmid

Vad består en nukleosid av? socker + kvävebas

Vad består en nukleotid av? nukleosid + fosfat

Vad innebär det att DNA-strängarna är antiparallella? de går i motsatt riktning

Hur stor är major groove? 3,4 nm

Hur stor är minor groove? 0,34 nm

Vilka är de tre grundläggande reglerna vid replikation av DNA? replikationen är semikonservativ, startar vid en specifik punkt och sprider sig i två riktningar längs kromosomen, sker i 5'->3'-riktning

Vad innebär det att replikationen är semikonservativ? den ena strängen bevaras alltid

Vilka är replikationens tre faser? initiering, elongering, terminering

Vad händer med DNA:et under initieringen? DNA-strängarna delas i origin av Helikas, stabiliseringsproteiner hindrar strängarna från att snurra ihop sig igen, enzymet RNA-primas gör den första primern (RNA), DNA-polymeras kan börja replikation

Vad händer med DNA:et under elongeringen? enzymet Topoisomeras snurrar upp DNA, Helikas fortsätter dela strängarna, nukleotider ansluter till DNA-polymeras som avgör om de passar eller inte, DNA-plymeras (III) förlänger strängen med rätt nukleotid, DNA-polymeras (II) byter ut RNA-primern till DNA, enzymet Ligas sammanfogar Okasakifragmenten

Vad händer med DNA:et under termineringen? inte helt känt hos eukaryoter men: replikationsgafflar möts på flera platser i kromosomen, replikation sker inte ända ut i ändarna vilket gör att DNA förkortas något vilket betyder att antalet replikationer är begränsat innan en viktig del går förlorad, i könsseller finns enzymet telomeras som förlänger telomererna för att förhindra att bitar av kromosomen försvinner

Vad heter ändarna på kromosomer? telomerer

Click

Type

Listen

Games

Print